结核：
　　耐药能通过严格遵守结核病控制的各项原则加以预防 .这些原则是：识别新诊断的原发耐药高危险的结核病人；对所有新诊断的病人给予合适的治疗方案；正确处理治疗失败和复发病例；治疗期间尽量给予完全的督导治疗，至少在强化期执行。
　　耐药结核病的治疗原则应以药物敏感结果为指导，根据药敏试验结果制订个体化的治疗方案。
　　耐药性结核病的研究：对耐药性的快速识别和诊断尚缺乏可靠的方法；即使有明确的药敏试验结果，对耐多药的病人也缺乏有效的治疗手段，尚有待于新的有效的抗结核药物的开发，免疫治疗的发展等。
　　多耐药结核病是迫切解决的跨世纪难题：结核病的多重耐药，造成治疗失败，加重耐药菌传播，从而导致原发耐药结核病的增多。 多重耐药结核病的产生通常是由于结核病控制规划管理不善，造成大量久治不愈的多耐药的慢性传染源。因此，研究控制传染源是我国结核病控制和结核病学科的研究重点。

肺癌：
　　肺癌临床及基础研究我所已经走过了半个世纪的历程，取得了一批临床、基础研究成果，得到国内外学术界的广泛公认，居领先水平。本项工作的目的是在既往研究的基础上，发挥我所基础研究优势，二者结合 , 从基因水平深入研究和探讨提高 Ⅲ期肺癌综合治疗效果的方法。 开展 Ⅲ期肺癌扩大手术根治、多脏器同时成型术的临床研究，扩大Ⅲ期肺癌手术适应证； 开展 Ⅲ期非小细胞肺癌新辅助化疗疗效研究 ,并 通过基因工程的方法开展 药物敏感性及免疫组化指标测试 ，为术后化疗提供帮助；开展化、放疗同时进行治疗中、晚期肺癌的研究，为晚期患者提高生活质量探讨新路。 开展提高小细胞肺癌综合治疗疗效的研究，探讨规范化综合治疗模式及 通过基因工程的方法开展耐 药病例 检测等。通过上述工作培养一支基础与临床紧密结合的人才队伍。