北京农学院兽医专业是北京市特色专业。该专业学位依托北京市重点实验建设学科－临床兽医学和校重点学科－基础兽医学两个硕士点。学科内尚有北京市重点实验室－兽医学（中医药）实验室，中国传统兽医学国际培训中心，动物医院及标准的实验动物房，并有华都肉鸡公司，美联众和动物医院联盟等12个教学实习基地。学科师资力量较雄厚，目前共有21名导师，其中教授10名，副教授11名，博士学位或在读博士者占70％以上，目前有科技部“十一五”支撑计划，国家自然科学基金及北京市重点科研项目30余项，在研经费1000多万元。学科内拥有流式细胞仪，核磁共振，荧光定量PCR，高效液相色谱，气－质联机等大型仪器设备30余台（套），可满足实验需求。设有临床兽医学、基础兽医学、预防兽医学等方向，并在中兽医学宠物临床、人畜共患病研究领域有较好基础。该学科与日本麻布大学建立了姊妹校合作关系。

主要招生对象：兽医（畜牧）专业一线工作的执法、检验检疫人员、兽药厂、畜牧兽医站、饲料厂、畜牧与水产养殖企业等工作人员及应届大学本科毕业生。