北京农学院作物学科是学校重点支持和发展的学科之一。具有作物遗传育种学科硕士授予权。现有教授11名，副教授4名，具有博士学位的教师占40%。导师队伍中北京市优秀教师1人，北京市青年骨干教师2人。作物遗传育种学科有作物种质资源创新与利用、作物抗逆育种与品质改良和作物分子遗传与育种3个研究方向，主要从事豆类种质资源创新与利用、豆类育种、玉米群体改良、玉米遗传育种、小麦遗传育种、甘薯遗传育种和作物分子育种研究，以开展应用基础与应用技术研究为主，形成了自己的特色。本学科立足北京都市农业，以京郊主要农作物新品种选育为核心，为北京的创汇农业、籽种农业提供人才与技术支持。

近5年来，本学科获北京市科技进步二等奖、北京市科技进步三等奖、北京市金桥工程一等奖、北京市农业技术推广二等奖、昌平区技术推广一等奖、北京市教育教学成果奖和北京市精品教材各1项。

作物学科在玉米、小麦、红小豆、甘薯、杂粮等方面，建有10个试验示范基地，在作物育种、良种繁育、生产管理、种子经营等方面发挥了重要作用。