马克思主义理论一级学科硕士点依托马克思主义学院、红船精神研究中心，涵盖马克思主义基本原理、马克思主义中国化研究、思想政治教育、中国近现代史基本问题研究等四个二级学科，其中马克思主义在中国早期传播研究、中共创建史研究、红船精神研究等方面具有鲜明特色。现有硕士生导师30余人，其中享受国务院特殊津贴专家1人，中宣部宣传思想文化青年英才1人，浙江省高校中青年学科带头人3人，浙江省新世纪“151工程”人才1人。近年来与浙江师范大学、延安大学、东北石油大学联合培养研究生20多名。

学科拥有教育部人文社科重点研究基地“嘉兴学院中国共产党革命精神与文化资源研究中心”、“教育部全国高校思想政治理论课教师社会实践研修基地（嘉兴学院）”、“浙江省中国特色社会主义理论体系研究中心嘉兴学院研究基地”、浙江省哲学社会科学重点研究基地“嘉兴学院浙江省中国共产党创建史研究中心”、浙江省2011协同创新中心“浙江省红色文化研究与传承协同创新中心”、“浙江省习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心嘉兴学院基地”等多个省部级研究平台。近5年来，获得省部级奖项10余项，其中教育部人文社科优秀成果奖一等奖、二等奖各1项；获批省部级及以上项目60余项，其中国家社科基金重大、重点项目2项；获得省部级科研奖项10余项，其中全国高校人文社科研究优秀成果一等奖、二等奖各1项；《红船精神“五化”育人体系的构建与实践》获高等教育（本科）国家级教学成果奖二等奖、浙江省教学成果奖特等奖。