皖南医学院基础医学学科建于1958年，对我校乃至皖南地区的医学教育和科学研究做出了巨大贡献。自学科建立以来，涌现出了一批优秀教育工作者，如人体解剖学教授江家元、组织胚胎学教授齐易祥、病理生理学教授文尚武、微生物与免疫学教授吴敏毓、病理解剖学教授林鸿民等，在他们的辛勤耕耘与带领下，我校于1981年成为国家首批硕士学位授权单位，1998年、2000年、2006年先后获批法医学、病原生物学和病理学与病理生理学二级学科硕士学位授权点，2010年获批基础医学一级学科硕士学位授权点，为国家培养了众多优秀人才，如中科院肿瘤研究所的王明荣教授(博导，杰青获得者)、上海交通大学医学院的徐晨教授等。

本学位点秉承老一辈学者的优良学风和严谨的治学精神，各研究方向与学科内涵密切相关，继续发扬老一辈学者研究的特色，结合现代研究技术、科学进展和社会发展需要，经过多年的建设，已发展为相互支撑、协调发展、相对稳定的5个特色鲜明的研究方向，发展潜力大，部分学科在国内相关领域达到先进水平。