本学科包括合成药物化学及天然药物化学两个研究方向。合成药物化学方向以来源于天然产物或国内外报道的先导结构为基础，应用计算机辅助方法，设计合成目标化合物，寻找具有特定药理作用的活性分子；同时还选取国外专利过期化学药物，开展仿制药的合成工艺研究。天然药物化学研究方向针对贵州特色植物和贵州地道药材开展化学成分分离和活性研究工作，进行有效成分或有效部位的创新药物的研发，同时开展基于靶细胞萃取与UPLC-MS/MS技术联用的药效物质快速筛选、分析研究，以及基于UPLC-Q/TOF技术的代谢组学研究。

    药物化学学科师资队伍有共13人，其中教授3人，博士3人，教育部新世纪优秀人才1人。近年来本学科方向在新型抗糖尿病胰岛素增敏剂、非环核苷膦酸酯类抗乙肝病毒药物、肿瘤血管生成抑制剂、瓜环（Cucurbit[n]urils）包合活性化合物以及基于脑靶向性设计思路的黄酮类衍生物合成与生物活性评价等方面取得了较好的研究成果，并得到了国家自然科学基金（No.20962004、30960462与81260473）及多项省级基金的资助，研究工作达到了国内先进水平。本学科方向还系统进行了贵州苗药及地道药材的药效物质基础研究，以及灯盏乙素苷元、黄连素、斑蝥素等的结构改造工作。通过与企业合作，完成了两个仿制药的药学研究工作，10余个合成药的合成工艺研究，为企业获得生产批件2个。

    近5年共承担或完成了科研项目27项，科研经费近300万元。导师及研究生在SCI收录期刊的《Chemical Reviews》，《Tetrahedron》，《Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters》国际期刊上发表研究论文20余篇，国内期刊发表研究论文40余篇，申请或获得发明专利8项，创建企业联合实验室1个。