作物生物技术学科是作物学一级学科下自主设置的二级学科，为作物遗传资源发掘、新品种创新培育、遗传生理机制发现等作物遗传改良提供先进的技术方法和手段。

       该学科现有教学人员32人，其中教授6人，副教授16人，博士15人，硕士生导师7人。

       学科设4个主要研究方向：

      （1）作物基因工程：该方向重点开展作物重要性状的基因工程与分子生物学方面的研究。利用结构基因组学、功能基因组学的最新研究策略和研究体系，在优良外源基因克隆、转化等层面开展系统研究，为作物性状鉴定、品质分析、资源创新等研究提供高效的技术方法和理论支持。该方向研究重点主要有：作物高产、抗性及品质基因的克隆与转化；作物转基因新载体的构建及快速、高效转基因方法创新。

      （2）作物细胞生物技术：该方向主要包括作物细胞工程与作物染色体工程，前者主要研究作物组织培养、细胞培养、细胞分化、大规模繁殖等，研究植物离体生长的最佳条件和生物、非生物胁迫对离体作物生长的影响。这些研究不仅本身可产生新种质、新技术，更重要的是能为作物基因工程、生化工程、分子标记等应用研究提供精密可控的试验材料；作物染色体工程主要研究作物染色体分离、转移、图谱构建等分子细胞遗传学理论与方法，为作物遗传改良提供可靠的理论和有效实用方法。

      （3）作物基因组学及应用：该方向以现代分子标记技术为手段，分析作物种质资源的遗传多样性，构建作物分子遗传图谱，发掘作物重要性状优异基因及其等位变异，为育种程序制定正确的种质资源收集和保存策略，合理选配杂交种亲本，保护新品种权益以及标记辅助新材料选育提供理论依据。该方向研究重点：一是小麦功能基因发掘，主要研究小麦重要性状的分子标记定位、功能基因发掘及小麦新核型品种创建；二是棉花品种DNA指纹图谱构建与基因定位；三是大豆高产相关重要基因和优异等位变异的发掘。

      （4）作物蛋白质组学及应用：该方向利用蛋白组学和生物信息学技术，研究作物重要性状蛋白质水平的表达特点和代谢特征，通过差异蛋白筛选和全蛋白组分析，发现不同功能基因之间的相互关系和作用方式，发现特殊功能基因表达特征和对性状的控制途径。重点研究小麦、棉花、玉米光温敏雄性不育基因、抗病基因、品质基因在特定发育时期的蛋白质组学和差异蛋白分离和鉴定，与基因组学结合，分离和挖掘新的功能基因。