学校占地面积796675.3m2，分南（新）校区、北两个校区，设有基础医学院、第一临床医学院（下设中医系、中西医临床医学系）、第二临床医学院（下设临床医学系）、药学院、针灸推拿学院、护理学院、医学技术学院、公共卫生学院、人文管理学院、外语学院（国际教育学院）、继续教育学院、体育部、马克思主义学院、国际教育学院等14个教学单位和儿科学院、妇幼保健学院等2个医教协同共建单位，4所直属附属医院、14所非直属附属医院以及陕西中医药大学制药厂、陕西医史博物馆和陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心。

省级重点实验室中药基础与新药研究重点实验室和体质与疾病基础研究重点实验室；

省级工程研究中心中药饮片工程技术研究中心；

省“13115”科技创新工程技术研究中心秦岭中草药应用开发工程技术研究中心；

省级哲学社会科学重点研究基地中医药文化传承与发展研究中心；

中医药科研三级实验室中药药理实验室、中药制剂实验室和分子生物学实验室；

中医药科研二级实验室中药鉴定学实验室、中医分子生物实验室、中西医结合免疫实验室、中药药理实验室、中药制剂实验室、分子病理学实验室、针灸推拿实验室和血管神经生理学实验室；

省级重点研究室陕西省胃肠病证方药重点研究室和陕西痰瘀论治中医脑病重点研究室。 

        2025年，学校将在中医基础理论、中医医史文献、中医内科学、中西医结合、中药学、内科学、儿科学、肿瘤学、全科医学（中医）、公共卫生、护理、药学、国际中文教育等31个专业领域及中医药文化学、中医药管理学、中医技术装备工程3各自设二级学科招收硕士研究生。

目前有各类在校学生近1.6万名，其中研究生2949名。