学校现有番禺、越秀两个校区，占地面积37.23万平方米，建筑面积48.65万平方米。下设22个学院，19所附属医院，28个研究机构。拥有1个国家医学中心，1个国家临床医学研究中心，1个国家重点实验室，11个省部级重点实验室，3个省部级工程技术研究中心/工程实验室，3个省部级协同创新中心、1个国家大学科技园培育基地、32个市（厅）级重点实验室。拥有1个国家重点学科，7个省部级重点学科，32个市（厅）级重点学科；临床医学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学、生物学与生物化学、免疫学、神经科学与行为学、微生物学进入ESI排名全球前1%，全学科ESI综合排名位居全国高校百强。学校拥有19个国家临床重点专科，80个省（部）级重点专科，其中呼吸内科排名全国第一、小儿外科排名全国第二、变态反应科排名全国第三、胸外科排名全国第六、精神医学专科排名全国第七、小儿内科排名全国第八。

学校坚持“人才兴校”战略，现有教职工7789人（其中校本部908人），包括中国工程院院士、长江学者、国家自然科学杰出青年基金获得者、新世纪百千万人才工程国家级人选、国家级教学名师、国家有突出贡献专家、国务院政府特殊津贴专家等一批优秀教师；博士研究生导师683人，硕士研究生导师1279人。