学院始终把科研工作放在重要位置，引导广大教师在搞好教学的同时，积极从事科学研究、科技开发、科技推广和科技服务。自1999年以来，学院大力开展了科研体制改革，实施了科研激励机制，完善和规范了科技工作的管理办法，调整了学校科技工作方向和研究重点，确立了“科教兴院”的发展理念，全院教职工参与科研的意识和积极性显著增强，参加科研人数达到专业技术人员的80%，科研立项和科研水平明显提高。科研以提高学术地位与学校竞争力为目标，瞄准国家经济建设、社会发展中的重大问题，面向地方经济建设主战场，以中医药新药研究与应用开发为重点，注重中医药基础与临床的紧密结合，加快中药现代化、产业化的研究。

　　目前，学院承担国家及部省厅局级科研课题400余项。其中国家“863”计划项目1项、“九五”、“十五”科技攻关项目14项，国家自然科学基金5项，教育部重点研究项目4项，国家中医药管理局攻关课题及诊疗技术项目19项，省重大科技攻关、自然科学基金、教育厅课题436多项。在重大项目申报方面我院先后有23人次在河南省杰出青年科学基金、省杰出人才创新基金、省高校杰出科研人才创新工程基金等重大项目中获得资助。近几年来，随着科技体制改革和科技拨款方式的改进，学院更新观念，多渠道争取科研经费，特别是集中优势多方位申报国家或省部级重大课题，使科研经费逐年上升。2000年以来纵向科研经费达4276万元，其中作为国家十五科技攻关计划的防止艾滋病重大课题总负责人和牵头单位，仅此一项直接经费就达2400万元。近五年来，我院获省部级科技成果奖58项，申请专利10项。同时，与企业联合的横向经费也不断增加，正在逐步形成产学研联合，共同开展科学研究的良性循环。

　　学院十分重视科技成果的转化，研制开发的小儿泻速停、热速清、寒痹停、镇心痛、复方冬凌草含片、归元健脑片、灵蓝口服液、白虎羚退热散等中药新药已投入市场，产生了良好的社会效益和经济效益，为中医药产业发展作出了贡献。