学校拥有国家重点学科2个、国家重点培育学科1个，国家临床重点专科建设项目33个，省级重点学科（群）21个，省级领军人才梯队31个。在第四轮学科评估中，1个学科进入Ａ类（A-）、8个学科进入Ｂ类（2个B+、3个B、3个B-）。有国际合作联合实验室2个，省部共建国家重点实验室培育基地1个，教育部重点实验室4个，卫健委重点实验室3个，省级重点实验室13个，省普通高校重点实验室11个。黑龙江省“头雁”团队6个。与地方政府和企业共建院士工作站2个。建立了北方医学转化研究合作中心。